Il controllore di volo, il cervello dell'UAV, è responsabile dell'elaborazione dei dati di volo e dell'esecuzione dei comandi di volo. I controllori di volo-di fascia alta in genere sono dotati di più modalità di volo (come il posizionamento GPS e le modalità di assetto) e capacità intelligenti di evitare gli ostacoli, rendendoli adatti per applicazioni professionali. Il modulo GPS fornisce informazioni precise sul posizionamento, particolarmente importanti per gli scenari che richiedono un posizionamento ad alta-precisione, come la fotografia aerea e il rilevamento.
